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Leben auf der Überholspur? Eine vergleichende Analyse von Genexpressionsprofile über jährliche, halbjährliche und nicht-jährliche Killifische (Cyprinodontiformes: Nothobranchiidae)
Leben auf der Überholspur? Eine vergleichende Analyse von Genexpressionsprofile über jährliche, halbjährliche und nicht-jährliche Killifische (Cyprinodontiformes: Nothobranchiidae)
Life in the fastlane? A comparative analysis of gene expression profiles across annual, semi-annual, and non-annual killifishes (Cyprinodontiformes: Nothobranchiidae)
Autoren:
Chi Jing Leow, Kyle R. Piller
Abteilung für Biowissenschaften, Southeastern Louisiana University, Hammond, Louisiana, Vereinigte Staaten von Amerika ¤ Aktuelle Adresse: Abteilung für Biochemie und Zellbiologie, Boston University School of Medicine, Boston, Massachusetts, Vereinigte Staaten von Amerika * kyle.piller@selu.edu
Der Türkis-Killifisch ist aufgrund seiner kurzen Lebensspanne ein wichtiges Wirbeltier für die Erforschung des Alterns und altersbedingter Krankheiten. Innerhalb der Nothobranchiidae haben Arten eine jährliche, halbjährliche oder nicht-jährliche Lebensgeschichte. Wir haben einen vergleichenden Ansatz gewählt und das Gen untersucht Expressionsprofile (QuantSeq) von 62 Individuen aus elf Nothobranchidenarten, die umfassen drei Lebensgeschichten. Unsere Ergebnisse zeigen signifikante Unterschiede in der Differenzierung Gene (DEGs) über Lebensgeschichten hinweg, wobei nicht-jährliche und halbjährliche Gene am ähnlichsten sind, und einjährige Pflanzen sind am ausgeprägtesten. Bei feineren Maßstäben stellten wir signifikante Unterschiede fest DEGs für DNA-Reparaturgene und zeigen, dass nicht- und halbjährliche Gene ein ähnliches Gen aufweisen Ausdrucksprofile, während Einjährige deutlich ausgeprägt sind. Die meisten GO-Begriffe sind mit Jahrbüchern angereichert hängen mit Stoffwechselvorgängen zusammen. Allerdings sind auch GO-Begriffe, einschließlich Übersetzung, Proteintransport und DNA-Replikationsinitiierung, in Jahrbüchern bereichert. Nichtjährliche werden bereichert in Genen des Notch-Signalwegs und im kanonischen Wnt-Signalweg im Vergleich zu einjährigen Arten herunterreguliert, was darauf hindeutet, dass nicht-einjährige Arten eine stärkere Regulierung aufweisen in zellulären Prozessen. Diese Studie liefert Belege für die Kongruenz der daran beteiligten DEGs Lebensgeschichten und liefert starke Beweise dafür, dass es sich um einen bestimmten Satz von Kandidatengenen handeln könnte. Es lohnt sich, sie zu untersuchen, um ihre Rolle im Alterungsprozess zu untersuchen.
PDF zum Download [[File:journal.pone.0308855.pdf]]
notho2
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